Az MTMI Iskola Program hét alapelv mentén valósul meg, amelyek közül kiemelten fontos az iskolai csapat (pedagógusok, diákok, szülők) létrehozása és aktív együttműködése, az MTMI programok láthatóságának ösztönzése, valamint a gyakorlatorientált, élményalapú tanulás (pl. kísérletek, robotika és projektek) előtérbe helyezése, továbbá az MTMI-tantárgyak közötti integráció, a tanórán kívüli lehetőségek bővítése, és a piaci nagyfoglalkoztató partnerek bevonása.

A programba bekerülni kívánó iskoláknak egy átfogó pályázati minősítési eljáráson kell részt venniük, amely végén az alapítvány kuratóriuma és az általa felkért minősítési szakemberek döntése alapján kiválasztott intézmények 3 évet kapnak a tudományos, szaktárgyi portfóliójuk összeállítására és gazdagítására, melynek leteltével minősített MTMI-Iskola elismerést szereznek. A minősítés egy olyan toborzási előnyt biztosító, vonzó jelző az iskola számára, amely egyszerre segíti a MTMI orientálódású diákok és elkötelezett pedagógusok bevonzását.

A kiválasztott iskolák az egyes partnercégek jóvoltából számtalan színes programlehetőségben részesülnek: gyárlátogatásokon, szakmai és nyílt napokon, pályaorientációs tanácsadásokon és előadásokon vehetnek részt, de egyetemekkel és más szakmai szervezetekkel (mint a Nők a Tudományban Egyesület, a Kutatók Éjszakája stb.) is kapcsolatba kerülhetnek. A folyamat kimeneti célja, hogy a folyamatosan épülő és megújuló hálózat hatására meginduljon az e területekre irányuló munkaerőáramlás.